微生物肥料不能代替化肥，它與化肥是互補的關(guān)系�；实母邼B透比和復(fù)合肥加工
過程，造成微生物的大量死亡和高額的成本，都使化肥和微生物肥料不可能復(fù)合。使用微生物肥料可以減少化肥用量、增加農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)量、改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)，是其主要的經(jīng)濟效益；改善土壤結(jié)構(gòu)、保護生態(tài)環(huán)境是微生物肥料社會效益的表現(xiàn)。
有機肥具有養(yǎng)分齊全、肥效持久的優(yōu)點，但也有其明顯的缺點�；署B(yǎng)分濃度高，吸收快，但成分較單一或不齊全，改土效果較差。兩者配合施用，則可優(yōu)勢互補，發(fā)揮用地與養(yǎng)地的雙重作用，既提高土壤生產(chǎn)力獲得增產(chǎn)，又保持地力更新。有機、無機肥配合施用，既能減少化肥的養(yǎng)分流失，又能減輕土壤對化肥中某些營養(yǎng)元素的固定，提高化肥利用率，從而從總體上提高養(yǎng)分的供給率。由于有機肥具有較大的陽離子交換量，因而能夠?qū)手幸恍┮琢苁У酿B(yǎng)分有效地吸附和保存。有機肥分解產(chǎn)少的有機酸能提高鈣鎂磷肥中遲效磷的有效性，從而提高了化肥肥效。
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